Pagrindinės LSMU ligoninės viešosios įstaigos Kauno klinikų filialo Vaikų reabilitacijos ligoninės "Lopšelis" veiklos sritys:
 
1. asmens sveikatos priežiūros paslaugų teikimas vaikams,
2. būtinosios medicinos pagalbos teikimas,
3. vaikų sveikatos priežiūra ir su tuo susijusi socialinė globa bei ugdymas,
4. mokamų asmens sveikatos priežiūros paslaugų teikimas,
5. dienos ir trumpalaikės socialinės globos paslaugų teikimas,
6. dalyvavimas vykdant mokslinius projektus, visuomenės sveikatos priežiūros programas,
7. dalyvavimas sveikatos priežiūros specialistų rengime ir tobulinime.